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地图炮攻击我方有经验和资金，可以用来自残练级，比如过关之前把自己人先清理一遍，反正修理费和获得的资金也差不多。1.1版ROM修复。
人物达到100级的时候 查下看人物能力会花屏。1.1版ROM改为最高能达到99级。
第四次的深海地形，如果机体的移动类型没有海，一般格斗武器即使对海适应是A，也是潜不下去砍人的，只有1格的射击武器（比如泰坦光线）和远程武器可以用。但是一些武器不知为何算成了射击武器，可以对无法进入的地形使用。
グレンダイザー的ダブルハーケン
ドリルスパイザー（钻地斯陪沙） 的ドリルアタック
バトルジェット的ドスブレッシャー
ガブスレイ (MA)的クローアーム （仅PS版）
ダイモス的必殺烈風正拳突きⓅ
兽魔将军的驾驶员系统莫名被设定为艾尔盖姆系列。
第4次S地图第三十三话Ａ トータル·バランス的敌方增援中存在黒騎士驾驶的ガラバ（加拉巴），但在此地图遭遇时不会被收录至机器人图鉴。
设定会加入的援军登场前敌全灭，会出各种各样的问题:
断空我小队登场那一话在他们登场之前将敌全灭，断空我会以合体状态加入，然后之后忍会驾驶断空我而不是鹰战机登场，只占一个出击名额但是分离出来就有四部机体可以用，这是个有助于速通的bug。
第三十四话Ａ 新しい力中マサキ・アンドー（安藤正树）登场之前将敌全灭，他就不会加入，连带的琉妮相关的事件也不会发生。PS版修复。
第十九话 あしゅら男爵の最期中，二次行动的机体如果在到达出口时选择再次移动，那么机体会撤退，但是在原地会出现一个行动过的残影。PS版修复。
没有指定机师的妖精，跟第一个人物（SFC版是甲儿，PS版是主人公）共享经验。
用Game Over大法，失败前获得的经验保留，但是妖精除外。
第二十一话 Dr.ヘルの野望这一话，被アッザム的地图武器攻击也会获得经验和钱，数量同上一次战斗。
第三十一话 キリマンジャロの嵐这一话，虽然地图上满是云看起来是空战，机体出击的时候，不能飞的不能出击，出击的也不能变形到不能飞的形态，然而地形适应是陆，对陆适应差的战斗会很吃力。グレンダイザー (MS)(潜水古连泰沙)和グレンダイザー (DS)(钻地古连泰沙)，虽然移动类型是水陆空和空陆地中，理论上不管地形算空还是算陆都可以进入的，合体之后就是移动不了或者直接死机，要装空飞芯片才能正常行动……
第四十话Ａ 月の裏側选人去甘泉殖民地的时候，塔巴如果等级低于30，那么会有剧情发生，说阿姆等级太低会成为累赘。估计因为搞错了人的原因，塔巴和阿姆最后还是去了甘泉殖民地……
第四十三话 荒野の死闘这一话，第一回合用地图武器将我方机体击落，再复活出来的会是敌军。第二回合恢复正常。PS版修复。用这个方法，可以让没有地图武器的机体在这里用自己人练级。PS版修复。
第四十三话 荒野の死闘这一话，第一回合让我军全灭，按确定重新开始的时候，出击的选择是A队而不是B队。一开始让主人公和阿姆罗出击的话，第二回合增援时主人公和阿姆罗又会强制出击，战场上会出现两个副本。PS版修复。
第四十三话 荒野の死闘这一话，使用觉醒第一回合通关的话，不会触发合流事件，将仅靠A队攻略最终话，难度上升。
双鱼座A型血有两个必中，以至于只有5个可用精神，以至于制作人じっぱひとからげ向玩家谢罪，承诺在移植版中改进。他们在PS版中获得了奇迹。然而巨蟹座AB型现在可以学得两个ひらめき……
战场上合体出来的机器人，例如超级高达或者古连泰沙，在被击破时会爆掉一个飞机，只留下本体。但是如果是被搭载在母舰上，母舰被击坠的话，复活出来的会是合体状态的机器人。这个机器人可以分离，但是如果取消分离指令的话，就不能移动了，除非再次和飞机合体。